lammps相关博文导航
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1. LAMMPS基本
- LAMMPS相关文件功能简介
- LAMMPS常用建模方法总结
- lammps中构建合金模型
- lammps输出的模型如何导入MS中建模
- Materials Studio构建的模型如何导入lammps?
- LAMMPS如何定义六角密堆结构HCP
- lammps的restart重启动相关
- vasp poscar结构转lammps结构文件
- xyz2lmp: 将xyz格式转成lammps的data file
- 如何使用atomeye将lammps的模拟结果做成视频动画
已有 35 条评论
ERROR: Error reported: failed to launch 'lmp -in.Cu.txt' on DESKTOP-2P5R1RS
Error (2) 系统找不到指定的文件。
请问出现这种错误该如何处理啊?
博主我想问你您,lammps 想要实现耗散粒子动力学控温应该用什么命令,还有lammps应该是不能像输出温度,压力这样的直接输出表面张力的吧,是不是要再in文件中输入计算公式。
博主,如果lammps提示warning:Too many common neighbors in CNA 2 times此类的话,该如何解决呢?是neighbor skin bin设置大了还是小了
您好,这个问题您怎么解决的呢?
博主,您好,我想请教您一个问题。做拉伸的时候,大多数是设置应变率进行控制,我想通过应力控制怎么做?
我的qq:2571858550
博主,我做级联碰撞的,想问一下,首先我要确定一个位置,然后寻找与这个位置最近的一个原子,有且只能选择一个原子,用命令要怎么实现!
请问下博主,怎么将分子动力学仿真输出的动能转化为温度,然后用fix ave/time 进行平均后输出?我用的
compute KE Gui ke/atom
variable k1 atom c_KE/(1.5*1.986857e-3)
fix 5 Gui ave/time 100 5 1000 v_k1 file Ke.profile 但提示有错误,请大神不吝赐教
输出的信息中有温度啊?
fix 2 all npt temp 700.0 700.0 100.0 aniso 0.0 0.0 10.0 drag 1.0
博主,您好,感谢上次您对我的问题的解答,让我受益匪浅。想请教您一个新的问题,就是我用上面的指令来控温,但是一运行,发现温度刚开始会一下子变成1600K,然后才降下来,不用这条指令,温度就没有这种爆炸的情况,想请问您这是怎么回事,有什么办法可以替代这条指令吗?对了,我的材料是铜铝。
博主,您好,您的文章对我帮助很大,在此表示感谢!但是对势函数的调用命令还是感到很困惑,就是我做的是铜的拉伸,但是有很多单向铜的势函数,我应该怎么选择呢?我目前选择的是Cu_u3.eam,我用的指令是pair_style eam pair_coeff **Cu_u3.eam Cu,但是一直显示有问题,希望博主能帮忙解答,万分感谢!
你好,我做的是Ni-Ti的拉伸卸载循环模拟,咱两的有相似之处,能不能加个好友,讨论下
小同行加个QQ:799507993
你好,我也是研究NiTi合金的,能否加你个好友?
可以呀。你qq多少?
试试下面的命令:
pair_style eam
pair_coeff * * Cu_u3.eam
参考:http://lammps.sandia.gov/doc/pair_eam.html
您好,我是LAMMPS新人一枚,想问一下没有找到自己需要相关的势函数,如果要自己搞势函数难度大吗?
建议你看看这篇文章:如何找到自己需要的原子间相互作用势函数?
http://www.52souji.net/how-to-find-interatomic-potential.html
博士,您好,
一直在看你的博文,对我这个初学者帮助很大,在此感谢!因为刚接触这个没有多久,看了您关于势函数部分的博文,但还是不清楚该怎么调用这些命令,比如我做切削单晶Si的模拟,采用tersoff势函数,但不太清楚命令里的数据对应的是什么意思,能不能详细讲下LAMMPS中势函数调用命令该怎么写。
万分感谢了,相关资料太少,现在无从下手,希望能得博士的解答~
pair_style tersoff
pair_coeff * * Si.tersoff Si
参考:http://lammps.sandia.gov/doc/pair_tersoff.html
好的,谢谢博士~
您好,博主!
本人做切削方加工,之前做有限元的,博士课题是跨尺度模拟,因此涉及分子动力学!请问下能否推荐几本您认为的关于分子动力学学习的经典书籍,当然最好是关于lammps,麻烦您了!
关于分子动力学的书:
英文
Ercolessi, Furio:Computer simulation of liquids
Allen, M P:A molecular dynamics primer
中文
陈舜麟:计算材料科学
张跃、谷景华等:计算材料学基础
关于lammps我还没看到过。
你好,请问想用分子动力学方法做模拟,但又找不到合适的势函数该怎么办?自己做一个势函数有什么难度?
请参考:【如何找到自己需要的原子间相互作用势函数?】
http://cms.52souji.net/viewtopic.php?id=21
您好,请教一下,对lammps的dihedral style opls 有个困惑的地方,比如还是我的体系二氯乙烷分子,C2H4Cl2, 有9个三种不同的二面角 即三种二面角的力场参数 对这9个二面角的能量贡献都得考虑是吧,谢谢答复
我个人没有做过有机物的模拟。我个人感觉都是要考虑的。不过也许这9个并不都是独立的。你自己考虑下。
先生您好!我是一名大三的学生,目前在做大创,从您的博文中得到了很多指引,谢谢!
然后现在我导师给我的一些关于LAMMPS的基础问题,我头绪不是很清晰,希望您看到以后可以给我一些指导!需要我做的都可以联系我的QQ583130935,我做的项目是“金属基底上石墨烯涂层力学性质研究”,以下是导师现阶段给我的问题,希望您可以推荐一些关于这个方面的文献和作者,也可以给我一些思路或者指引。也不一定要关于这些问题,有什么建议对LAMMPS新手说的都可以告诉我~先行鞠躬!
金属基底的模型如何导入?
金属与石墨烯之间的作用如何描述?
金属-石墨烯涂层的稳定平衡结构是什么形态?
作用面内剪切或拉伸荷载后涂层如何变形?
温度对变形有何影响?
您好!您的问题太个人化了,我不好回答。
楼主,您好。看了您的博文也没有找到相关的势函数,楼主知识丰富,对这方面的研究很深入,麻烦您能否帮我找一下Mo-C体系的势函数,万分感谢!
我在您博文中找到C-Fe势函数,可以用于第二个问题“金属与石墨烯之间的作用如何描述”吗?
理论上是可以的。但你需要测试。
您好,
界面模型建立的基本流程 模型中需要用到的势能,Fe、PP、Fe-C、Fe-H的势能,希望能够附上相应的文献出处 如果没有现成的势能,而我又暂时做不了实验标定,那么有什么建议呢您?我是学生,现在想要做Fe和PP的界面模型。不知道您能给我提供一些资料和指导吗?
请大神指点,不胜感激。如果需要收费,请告知,在我力所能及的范围内将尽力支付。
万分感谢。
联系方式:QQ782515448 (PS:可能需要验证,麻烦输入一下lammps就好了O(∩_∩)O~)
学了lammps一个多月才看到楼主的文章真是损失 万分感谢啊