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已有 156 条评论

  1. langlin

    我想问下:计算非晶时候voronoi/atoms 这个命令的中文,特别是我需要输出什么量,

    1. 我爱搜集网博主

      没有明白你想问什么,能否把问题再说明点?
      在论坛里提问哈~
      http://cms.52souji.net/index.php

  2. Zhengheng Li

    不知博主的博客服务器是否在国外,如果是的话推荐安装插件GravatarLocalCache,缓存一下评论头像的图片。另外我也有一个WordPress博客:www.zhli.net,好久没更新了,^_^

  3. Zhengheng Li

    博主的博客很不错,内容很多,不过觉得很多都太零碎了。

  4. 李昭

    博主你好,我想问一下有没有氮化钛的势函数和lammps的视频教学,如果有请您发到787405590@qq.com,谢谢.

    1. 我爱搜集网博主

      关于势函数,请自行在数据库网站上搜索。如果找不到,要么放弃该体系,要么自己发展势函数。根据我的粗略搜索,你这个体系是有的。

  5. qingtian

    博主您好,请问您有TiN的势函数吗?如果有请发送到23226700800@qq.com

    1. 我爱搜集网博主

      关于势函数,请自行在数据库网站上搜索。如果找不到,要么放弃该体系,要么自己发展势函数。根据我的粗略搜索,你这个体系是有的。

  6. 唐晓畅

    Michael你好,我看你也有一些常用软件的技巧之类的文章,这是我的博客http://blog.csdn.net/txcokokok,你要是觉得哪里还有用就尽管转载,真不是做广告(⊙o⊙)哦

  7. 王凯立

    您好,
    我刚开始学习LAMMPS。因为老板催的急,要我用一天半的时间给他一个稀土掺杂的α-Al2O3 模型。请大侠给予帮助,不胜感激。我有如下问题

    如何建立初始文件? 如何将杂质掺入?我有不掺杂模型,但是我手动掺杂后VASP不收敛,我不知道该如何解决。请大侠指点。 您有Al2O3 的potential吗?到哪能查到呢?我搜了半天,没有找到。有一篇文章(见附件)我还不确定,麻烦大侠帮忙给予判定。
    请大侠指点,不胜感激。如果您需要收费,请告知,在我力所能及的范围,将尽力支付。
    1. admin
      你说你已经有了不掺杂的模型,这就已经算是初始文件了,只不过你需要将其格式转换为lammps所要求的格式。具体如何转换,可以在本站搜索。 据我了解,第一性原理的掺杂一般都是手动进行的,至于为何你用vasp计算时不收敛,我想可能是参数设置的问题。 氧化物的势函数确实不是很多。你需要自己耐心搜索一下。如果搜索不到,很可能这个体系还不适合用分子动力学来模拟。
  8. 民用

    另外,请问2个问题
    能否介绍一下,如何如下功能:用material studio附上lammps中不具有的力场,如Dreiding,如何通过代码或其他工具实现导入到lammps中能用?
    lammps的msi2lmp的文件夹frc_file有compass_published.frc力场文件(2014,10发布)与material studio中的compass文件(那个加密的)算同一个吗,用了material studio的compass力场附加后,能否采用类似cvff力场文件导入到lammps中。

    1. 我爱搜集网博主

      你说的这个问题其实是一个比较普遍的问题,据我了解并没有通用的解决方案。compass势我不是很了解,你可以自己摸索一下。

  9. 民用

    楼主,你好!看了你的lammps系列,makefile系列,labtex系列,简直收益匪浅啦。我将你的lammps系列文档全部粘贴到一个word文档,打包成了pdf,想将其发到小木虫中,在此申请授权。 我是搜了很多,尤其是用百度等,是搜不到楼主的博文的或者不敏感,想将其推广。
    再次非常感谢楼主的辛勤劳作!

    1. 我爱搜集网博主

      只要你能够注明来源,欢迎转载。

  10. baldwim

    验证码好难啊,输了半天

    1. 我爱搜集网博主

      主要是为了防垃圾评论,请谅解。

  11. xulmp

    求建模孪晶铜和IN文件(shear)全过程
    谢谢您!

  12. 巧帅之风

    给力前应该加个修饰词,但觉非常不足以修饰这份强大!邮箱为qq号,恳请加qq。

  13. 岳晓明

    大大滴支持楼主,楼主这是你的个人博客吗 我还以为是开的网站 请问楼主现在在哪高就?高校还是企业?楼主真是辛苦了,可苦了一个人,幸福千万人,楼主就是当今的耶稣啊.

  14. 唐晓畅

    博主好,
    初学lammps,非常感谢博主无私提供这么多翻译内容。虽然其他论坛也有人认为翻译manual会助长惰性,但我认为翻译其实是很有帮助的。假如abaqus,ansys这些软件都不出中文版教程,它们怎么可能在中国推广?就拿我这样的来说吧,英语不算特别好,分子动力学的知识又没学过,很多内容自己用软件翻译了都看不太懂,而且英语水平不够还严重影响阅读效率。
    我认为如果能有一份中文教程,循序渐进地讲解lammps命令,包括实例讲解之类的东西,无论是对于大家的学习还是对于lammps的推广都是很有帮助的。诚然,会去用lammps的人英语的关迟早要过,但也存在很多像我这样水平还不高的人,入门时的关卡比较难过,如果能有一份博主这样的翻译,实在是有很大的帮助。
    不知博主今后有空了,水平更高了,会不会考虑搞一份这样的教程呢?当然了,这种教程一般不挣钱,何况lammps是免费,这个比较苦逼。
    另外,建议博主可以去各大论坛推广一下网站,因为我是很巧合的才看到这里,如果博主能加大一下推广力度相信会有更多人收益。

    1. 我爱搜集网博主

      基本上认同你的说法。我翻译这些文档也是为了将lammps入门的门槛降低,绝对没有否认官方英文manual的重要性。
      至于翻译,我也是业余时间进行,所以更新比较慢。

  15. 陈鹏

    我在装lammps的user-atc package时出现一些问题,首先我根据readme编译atc,不知为什么用make -f Makefile.g++会出错,后来输入make -f Makefile.serial编译成功,这个会有影响吗?
    接着修改Makefile.lammps,里面要写两个库的路径,但是我电脑没装,于是根据readme提示lammps里有个linalg,我编译了linalg,出来一个liblinalg.a库文件,我就写的这个库文件,后来重新编译lammps,会出错,提示
    ../../lib/atc/libatc.a(Matrix.o):在函数‘ATC_matrix::eigensystem(ATC_matrix::Matrix const&, ATC_matrix::Matrix const&, ATC_matrix::DenseMatrix&, bool)’中:
    /home/okagh/lmp/lib/atc/Matrix.cpp:131:对‘dsygvd_’未定义的引用
    /home/okagh/lmp/lib/atc/Matrix.cpp:138:对‘dsygvd_’未定义的引用
    ../../lib/atc/libatc.a(Matrix.o):在函数‘ATC_matrix::polar_decomposition(ATC_matrix::Matrix const&, ATC_matrix::DenseMatrix&, ATC_matrix::DenseMatrix&, bool)’中:
    /home/okagh/lmp/lib/atc/Matrix.cpp:203:对‘dgesvd_’未定义的引用
    /home/okagh/lmp/lib/atc/Matrix.cpp:209:对‘dgesvd_’未定义的引用
    collect2: error: ld returned 1 exit status
    make[1]: *** [../lmp_g++] 错误 1
    make[1]:正在离开目录 `/home/okagh/lmp/src/Obj_g++'
    make: *** [g++] 错误 2
    我在有个人的博客上也看到他解决了这个问题,他说是linalg这个库有问题,但是我觉得这个毕竟是验证了才放到lammps里的,所以我还是觉得自己编译有问题,能否为我解答下呢?

  16. 冯建锐

    你好,请问下如果输出lammps计算中每一个时间步中所有单个原子的坐标该怎么定义啊。没有找到如何定义单个原子的命令。我需要输出每一步中所有原子的坐标信息。

    1. 我爱搜集网博主

      可以使用dump,请查看其manual
      http://lammps.sandia.gov/doc/dump.html

  17. 王震

    我今天看了看有关分布式计算的介绍,不知道它能否用到我们lammps的计算里呢?学长在做计算的时候用到了么?

    1. 我爱搜集网博主

      我不太了解分布式计算,是不是与集群类似?
      LAMMPS在集群中的应用还是很普遍的,还有就是基于GPU的计算。
      不过这些都是效率层面的,与计算模拟本身关系不大。

  18. 涤生33

    在学LAMMPS,收获很多。谢谢博主。这个网站可以注册账号吗?

    1. 我爱搜集网博主

      这个是我的个人博客。所以不开放注册呀~~

  19. 王震

    不知道博主能不能增加个板块分享一些好的网站,比如说交大材料学院CMS网站课件、最近费恩曼讲义网页版之类的、鸟哥的linux之类的,这样可以增进学习嘛

    1. 我爱搜集网博主

      嗯,很好的建议呢!我后面会增加上的!

  20. 王震

    刚才才发现,我们都是Huster,非常非常激动啊,以后也是做计算模拟的小弟,请师兄不吝赐教啊,希望留个扣扣

    1. 我爱搜集网博主

      这里不好留扣扣。你有问题先给我发邮件吧~~