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已有 156 条评论
我是一个atomeye初学者,用atomeye来分析多晶模型内部缺陷处于迷茫状态,就比如说是通过配位数来分析分析模型,是如何通过删除正常原子而留下缺陷原子进行分析呢。
atomeye有一个功能就是根据配位数显示不同的颜色。至于你说的内部缺陷,这点我想可能需要定义一些指标,通过编写程序进行分析。
我是做多晶呢,看文献说是可以不显示配位数等于12的原子来观察,具体是怎么操作呢
文献是说atomeye这个软件吗?我没有用过这个功能。
段老师,atomeye中是无法用cna来显示不同颜色,但想要cna能在atomeye中着色有什么办法吗?因为cna着色后,能够显示出扩展位错(包括层错和不全位错),进而进行缺陷的分析,您会编程吗?还是换在ovito中用cna来分析?
在评价势函数时,很重要的一个指标就是看它是否能够应用于不同的晶体构型。具体来说,如果是很好的Fe的势函数,那它应该既能够应用于bcc-Fe,也能够应用fcc-Fe。当然,由于势函数都是经验性的,所以常常不能完全反应所有构型的所有特性。
哦哦,谢了老师
atomeye是不开源的。如果做不到只能换用其他软件了。ovito我没有用过,你可以试试。
老师想问下为什么网上没有fcc-Fe的势函数,只有bcc-Fe的?
是的,老师
谢谢博主分享,帮助很大,博主继续加油,也请大家多多捐赠。
谢谢支持!
楼主您好,我初学lammps,看见热膨胀系数的例子,自己测试后发现有些问题,麻烦您帮忙教我一下,给您发邮件您那边没有接收,真的不好意思打扰您了!
没有收到您的邮件。请在相应页面留言,描述您的问题。
博主能不能更新lammps的翻译系列之neighbor和neighbor-modify。
工作较忙,抽空更新,不要等我。:)
博主,请问能介绍一下,在镍表面渗碳的例子吗?
没搞过,自己网上找找吧。
支持楼主,辛苦了!
谢谢支持! :)
我有一些事咨询一下博主,不过邮箱形式看得不太懂
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博主您好,我不是来问问题的,我是来单纯感谢一下这个博客的,真是太棒了...
谢谢肯定支持! :)
您好,请问有Mo-W合金的eam势函数么,能发我一个么
博主也没有现成的。看看这篇博客:
http://www.52souji.net/how-to-find-interatomic-potential.html
博主,怎么计算离位阈能,或者能推荐相关方面的论文吗
抱歉,这个真没算过。你自己找找吧~
博主,有空能不能更新一下neighbor这个命令,skin distance、ghost atom、coulombic cutoff都有点看不懂,谢谢
不能承诺时间,只能说抽时间更啦~
博主,请问lammps能够计算电导率么?
没算过,感觉不能算。分子动力学是很难考虑到电子尺度的。热导率是没问题的。
博主有没有用过pwscf这个模拟软件呢
没用过。一直用VASP。
宝哥:
有几个建议:
1、做个RSS源
2、评论放在上端,放在下端会减少评论量
感觉现在用RSS的好少啊……第二个建议是很好,后面有空改改代码。
您好,您有没有碳硒的势函数啊?若是有的话,麻烦您发到1393736205@qq.com中,谢谢啦。
建议你看看这篇文章:
如何找到自己需要的原子间相互作用势函数?
http://www.52souji.net/how-to-find-interatomic-potential.html
博主你好,我想问一下,在src里面可以找到一些源程序,假如说meam,我怎样才能找到它的主函数呢,pair_meam.cpp里面都是定义的各个子函数,并没有说如何调用各个子函数。不知道您对这方面了解不?
meam是安装包,在lib目录下。
C60富勒烯,大神您知道怎样用lammps建一个C60团簇吗,要模拟硬度。 如何计算 C60 原子球(团簇)的硬度 (弹性模量)?这个怎么建初始构型啊
推荐MS。
博主,我想请教两个lammps的问题,
fix langevin 可以用来设置壁面温度,答案是他的参数不是region,而是group,我直接设置group * region * 就可以了吗?
还有一个问题,我的边界条件设置为f f f 我该如何实现壁面的碰撞反弹?
这个命令我也没用过,你可以多看看manual和相关理论基础。
我的晶胞结构是单斜的,具体参数是a:18.2876 b:12.0923 c:16.6120 alpha:90 beta:-103.40 gamma:90 ,lammps在create_box时用data.file,region的xlo,xli,ylo,yli,zlo,zli是怎么确定的。找不到相关的例子,急用。。。已捐助。。。
请参考帖子: http://cms.52souji.net/viewtopic.php?id=35
楼主 你好
我最近在做AlNi的分子动力学模拟,但在构建AlNi合金的模型时,老是出现问题。我的整体思想是构建盒子,在盒子里共放4000的原子(Al有2000个,Ni有2000个),我想用替换的命令,用2000个Ni随机的替换里边的2000个,但在这总是显示错误,希望您能帮我解答。谢谢楼主。方便的话,你能帮我简单的编写一下这个地方的脚本吗?不胜感激
请参考本站博文《lammps中构建合金模型》:
http://www.52souji.net/build-alloy-model-in-lammps/
想请问博主,有没有关于金和钯 比较准确的势函数?
据我了解,Pd-Au的势函数有好几个,主要是EAM系列的。
具体可以在论坛里交流:
http://cms.52souji.net/viewforum.php?id=5